Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 523.19■■□□□ 1.32e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 322.3■■□□□ 1.162e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-208ENST00000472446 473 ntTSL 322.2■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.062e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 321.53■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 GPS1-222ENST00000583983 556 ntTSL 520.88■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 319.78■□□□□ 0.762e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC61-205ENST00000596161 574 ntTSL 419.09■□□□□ 0.652e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CHEK1-215ENST00000533778 561 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-211ENST00000490392 673 ntTSL 315.62■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-210ENST00000484838 803 ntTSL 214.68□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 ARHGAP1-205ENST00000527588 2344 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-205ENST00000421096 662 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 BRD9-207ENST00000489093 1139 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 CCDC61-203ENST00000594672 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.11□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 AP1S1-202ENST00000429457 573 ntTSL 512.99□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MERTK-204ENST00000439966 2972 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MERTK-201ENST00000295408 3954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 25.5
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PRPF4O43172 FGFR1OP-206ENST00000496181 640 ntTSL 25.7□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 25.5
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PRPF4O43172 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.974e-7■■■■□ 25.5
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PRPF4O43172 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.924e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 25.5
PRPF4O43172 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 216.41■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 25.5
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PRPF4O43172 ZNF251-203ENST00000525191 618 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-17■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 DMTN-208ENST00000517418 977 ntTSL 216.58■□□□□ 0.242e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 317.19■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 25.4
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PRPF4O43172 RASA2-207ENST00000515549 494 ntTSL 417.85■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.983e-7■■■■□ 25.4
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PRPF4O43172 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 25.4
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PRPF4O43172 KIAA0753-203ENST00000570455 447 ntTSL 54.11□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 25.4
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PRPF4O43172 SLC50A1-205ENST00000465546 538 ntTSL 313.68□□□□□ -0.229e-8■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.349e-8■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-8■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.539e-8■■■■□ 25.4
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PRPF4O43172 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.069e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.958e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 AP006621.3-201ENST00000526588 291 ntTSL 219.28■□□□□ 0.688e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 23e-9■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.423e-9■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.273e-8■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 COL9A3-213ENST00000489045 838 ntTSL 521.88■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 COL9A3-202ENST00000452372 596 ntTSL 518.94■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 420.21■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 314.56□□□□□ -0.084e-13■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 513.21□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 511.9□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 25.4
PRPF4O43172 CNTROB-204ENST00000570782 752 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 513.57□□□□□ -0.242e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 410.58□□□□□ -0.724e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 517.94■□□□□ 0.469e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 214.15□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 TBCB-202ENST00000392178 791 ntTSL 222.31■■□□□ 1.168e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 TBCB-209ENST00000589308 659 ntTSL 318.01■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 MTPN-202ENST00000435723 879 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.993e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 25.3
PRPF4O43172 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 321.28■■□□□ 15e-8■■■■□ 25.3
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