Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNN4O15554 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNN4O15554 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms