Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC01565O15544 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC01565O15544 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms