Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLOCKO15516 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLOCKO15516 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLOCKO15516 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.9 ms