Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IPO8O15397 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IPO8O15397 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IPO8O15397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IPO8O15397 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IPO8O15397 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IPO8O15397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IPO8O15397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IPO8O15397 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IPO8O15397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IPO8O15397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IPO8O15397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IPO8O15397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IPO8O15397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IPO8O15397 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IPO8O15397 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IPO8O15397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IPO8O15397 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IPO8O15397 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IPO8O15397 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IPO8O15397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms