Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN3O15232 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN3O15232 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN3O15232 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN3O15232 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN3O15232 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN3O15232 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN3O15232 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN3O15232 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN3O15232 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN3O15232 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms