Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3R1O14745 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms