Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PES1O00541 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PES1O00541 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PES1O00541 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PES1O00541 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PES1O00541 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PES1O00541 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PES1O00541 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PES1O00541 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PES1O00541 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PES1O00541 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PES1O00541 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PES1O00541 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PES1O00541 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PES1O00541 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms