Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM22K7EJ46 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms