Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRRT4C9JH25 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT4C9JH25 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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