Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN25C9JDP6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN25C9JDP6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms