Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
B4DXG7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
B4DXG7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
B4DXG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
B4DXG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B4DXG7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B4DXG7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B4DXG7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DXG7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DXG7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DXG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DXG7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B4DXG7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B4DXG7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B4DXG7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms