Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYSRT1A8MQ03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CYSRT1A8MQ03 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms