Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRM3A6NNA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms