Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH2D7A6NKC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms