Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL33A6NCF5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL33A6NCF5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms