Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms