Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPDC1A2A3K4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPDC1A2A3K4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms