Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBA6A0AVT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA6A0AVT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms