Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F8A0AVK6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms