Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A0A0U1RRA0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms