Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0J9YY10 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0J9YY10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YY10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YY10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0J9YY10 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0J9YY10 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms