Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms