Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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