Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SPATA3Q8NHX4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SPATA3Q8NHX4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms