Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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