Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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