Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SRSF2Q01130 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms