Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms