Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms