Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2F8A0AVK6 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms