Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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