Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.3 ms