Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
LSAMPQ13449 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 C3orf35-201ENST00000328376 1859 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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