Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYT1P21579 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms