Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CYP2C19-201ENST00000371321 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms