Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCNAP12004 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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