Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FBXO48Q5FWF7 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FBXO48Q5FWF7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms