Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDLIM3Q53GG5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PDLIM3Q53GG5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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