Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP100Q494V2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms