Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD4L6Q3SYB3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms