Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL4BQ13620 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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