Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIP4K2AP48426 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms