Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms