Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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