Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
IFITM1P13164 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms