Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TMEM225BP0DP42 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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