Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00032P0C843 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms