Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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USP35Q9P2H5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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