Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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RNF182Q8N6D2 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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